Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SprtnG3X912 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SprtnG3X912 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms