Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usp32F8VPZ3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms