Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp9yF8VPU6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms