Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Gm28038F7BCN9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Gm28038F7BCN9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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