Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28048F7BCN0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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