Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Zfp672-203ENSMUST00000065533 2619 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sox5-205ENSMUST00000111749 3879 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Gm20538F6Z9R1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms