Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Crocc2F6XLV1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms