Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm42421F6X8D5 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms