Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngap1F6SEU4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngap1F6SEU4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms