Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Urb2E9Q7L1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Urb2E9Q7L1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms