Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K2

Gm17728, Predicted gene, 17728, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17728E9Q5K2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm17728E9Q5K2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm17728E9Q5K2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms