Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccdc71lE9Q4T4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms