Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
ApobE9Q414 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
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