Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Pdzd2E9Q1M1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Pdzd2E9Q1M1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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