Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20425E9Q035 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms