Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rsph10bE9PYQ0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rsph10bE9PYQ0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms