Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
Vpreb3D3Z6J4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Vpreb3D3Z6J4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms