Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm6685D3YYP3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms