Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ccdc170D3YXL0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc170D3YXL0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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