Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd1D3YXK1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd1D3YXK1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms