Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nlrc5C3VPR6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms