Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ppfia4B8QI36 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ppfia4B8QI36 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms