Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Abcc8B2RUS7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Abcc8B2RUS7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms