Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AU015836B2RUM3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms