Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mir670hg-205ENSMUST00000210851 1148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Apba1B2RUJ5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms