Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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PtprbB2RU80 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtprbB2RU80 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
PtprbB2RU80 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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