Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Zscan5bB2RTN3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zscan5bB2RTN3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms