Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Brpf3B2KF05 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Brpf3B2KF05 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms