Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CK137956B1AYM9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CK137956B1AYM9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms