Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nfx1B1AY10 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nfx1B1AY10 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms