Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprsB0V2N1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprsB0V2N1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PtprsB0V2N1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PtprsB0V2N1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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