Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem238A9JSM3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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