Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Skint7A7XV04 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms