Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prr16A3KMN5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Prr16A3KMN5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prr16A3KMN5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms