Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm5640A3KG49 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5640A3KG49 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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