Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atp8b5A3FIN4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms