Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rtf1A2AQ19 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rtf1A2AQ19 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms