Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CtcflA2APF3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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