Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lcn6A2AJB9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms