Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prdm12A2AJ77 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms