Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Frmpd4A2AFR3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Frmpd4A2AFR3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms