Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp8nlA2ABX0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms