Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pramef6A2A8M8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pramef6A2A8M8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms