Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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PtprfA2A8L5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PtprfA2A8L5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms