Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Calcoco2A2A6M5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms