Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer1Q9Z2Y3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms