Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Vamp5Q9Z2P8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vamp5Q9Z2P8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms