Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Mbd1Q9Z2E2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Mbd1Q9Z2E2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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