Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms