Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Uso1Q9Z1Z0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms